Lost 3. Sezon, Charlie’nin ölümüyle başlar ve Dharma Girişimi’nin tarihi hakkında daha fazla bilgi ediniriz. Sahilin diğer tarafında, Juliet ve diğerleri, Jack ve Kate’in yanı sıra Sawyer ve Locke’ın da dahil olduğu diğerlerini hapseden Others adlı bir grup tarafından yakalanır. Bu takım, sonunda Others’ın lideri Ben ile yüzleşir. Ayrıca, flashbacklerde Charlie’nin geçmişini ve Sawyer ve Kate’in kaçış planlarını görüyoruz. Lost 3. Sezon izleyicilerine ilginç ve heyecanlı bir yıl sunuyor.