Michael Scofield ve kaçma planları, 3. sezonun başında tekrar ön planda yer alıyor. Ancak bu kez, suçlu olan birine yardım etmek için hapishanenin içine girmek zorunda kalıyor. Mahkumların ölümle burun buruna geldiği bir hapishanede, Michael ve arkadaşları bir yandan hayatta kalmak için mücadele ederken, diğer yandan kaçış planlarını da yapmak zorunda kalıyorlar. Hatta belki de ölümcül bir yarışın içine giriyorlar. Prison Break hayranları, bu sezonun heyecan dolu anlarına tanık olacaklar. Her bölümde sıradışı olayların yaşandığı bu büyük macera, daha önce hiç olmadığı kadar yoğun ve heyecanlı olacak.